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多組學研究揭示牡蠣抗逆能力 成果於《自然》發表


http://www.wenweipo.com   [2012-09-21]

【本報記者郭若溪 深圳21日電】由中國科學院海洋研究所、深圳華大基因研究院等單位合作完成的牡蠣對潮間帶逆境適應的組學基礎研究成果20日在國際頂級學術刊物《自然》在線發表。華大基因表示,該成果的發表,標誌著基於短序列的複雜基因組拼接和組裝技術獲得了重大突破,在國際上填補了牡蠣為代表的冠輪動物基因組和海洋生物極端環境適應機制研究的空白,這也是我國海洋生物研究及水產經濟生物相關研究成果作為文章第一次登上《自然》雜誌。

據華大基因介紹,該項目利用新一代測序技術和全新的組裝策略,構建了牡蠣全基因組序列圖譜,證實了牡蠣基因組序列具有極高的多態性、較高比例的重複序列和活躍的轉座子。該項目還結合轉錄組、蛋白譜等最新組學技術,發現一系列與牡蠣抗逆能力相關的基因發生了明顯擴張,這可能是牡蠣適應潮間帶極端環境的主要分子基礎,揭示了在逆境適應中發揮重要作用的貝殼的複雜形成機制。

在本研究中,科研人員通過牡蠣的全基因組信息,不同器官、不同發育階段和不同環境的轉錄組信息以及牡蠣外殼蛋白質譜分析,深入探究了牡蠣基因組的典型特徵及其抗逆能力和外殼生物礦化機制。研究發現,牡蠣基因組大小約為559 Mb,包含約28,000個基因和大量重複序列,並具有高度多態性。此外,研究人員還發現大量與免疫相關的基因在牡蠣消化道內高度表達,這表明牡蠣等濾食動物的消化系統是其對抗外界病原體的一道重要防線。

中國著名貝類學家張福綏院士指出,該成果是國際貝類學研究的重大成果,提升了中國貝類及海洋生物學研究的水平,為貝類及其他水產物種的遺傳改良奠定了重要的遺傳學基礎。

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