據美聯社北京8月30日報道，菲中之間最大的問題是南中國海中的南沙群島之爭。菲方在中國聲稱擁有主權的海域勘探油氣。今年初，菲律賓政府指責中國侵擾其石油勘探船。中方則稱，菲軍最近在菲方聲稱擁有主權的一個島上搞設施建設違背了中國與東盟國家上月達成的初步協議精神。
菲律賓總統阿基諾在啟程訪華前表示，中菲都希望和平解決南中國海爭端。
據英國《金融時報》網站8月31日報道，馬尼拉和北京方面都淡化了外界對於兩國將在南中國海部分地區主權爭議問題上取得突破的期望。馬尼拉方面今年已5次聲稱並抱怨中國海軍侵犯菲律賓主權。
6月份，菲律賓聲稱並抗議中國海軍在菲方宣稱擁有主權的一個島礁附近進行建築活動。中國則正在抗議馬尼拉方面鼓勵在中國宣稱擁有主權的區域勘探油氣。
「我們會樂意達成這樣一個協議：既不讓這個糾紛升級，也不讓它影響我們兩國關係的其他方面，」阿基諾的發言人拉蒙·卡蘭丹表示。
中國駐菲大使劉建超表示：「這個問題已經存在幾十年了。我們不可能期望光靠這次訪問就能解決它。」
據新加坡《聯合早報》8月31日報道，菲律賓總統阿基諾昨天抵達中國。學者相信，通過此次訪問緩和南中國海緊張局勢是兩國最主要的日的。
中菲多年來因南中國海及島嶼的主權問題屢次發生摩擦，今年一連串的事故更讓爭辯升溫。先是中國軍艦被指侵入「菲律賓水域」，而後菲律賓又和美軍進行海上演習並在南沙群島修建軍事設施，引起中國抗議。
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