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 與那國島地理位置示意圖。資料圖
與那國島、石垣島和宮古島在地理位置上的特殊性，也使他們具有了重要的軍事價值。日本政府在去年年底制定的《防衛計劃大綱》中明確指出日本要把防衛重點從北方轉向南方，尤其要加強西南諸島地區的防衛。目前日本已經開始按照《防衛計劃大綱》逐步實施部署。
首先是部署調整。日本防衛省決定逐步把航空自衛隊那霸基地的戰鬥機數量從目前的約20架增至約30架，並把現有的1個飛行隊改編為2個飛行隊。以此加強對西南諸島的空中監視能力。另外將部署在沖繩首府那霸市的陸上自衛隊第一混成團1800人增加至2100人，並將其改編為旅，然後從這個旅派人駐守與那國島。日本防衛省已經著手購買位於與那國島西端的15-20公頃土地用作建立軍事基地，基地規劃包括直升機停機坪等。早在2010年前日本就在宮古島上建立了「日本航空自衛隊沖繩那霸基地宮古島分屯基地」。該基地是日本在其西南海域最大的無線偵查基地。作為補充與加強，日本防衛省還計劃將九州和沖繩的移動式雷達部隊部署到與那國島該基地，利用光學器械和雷達等加強對東海海域航行的外國船隻的監視。 | 
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