本次審計發現的主要問題包括：
(一)預算執行中存在的主要問題。
1.2009年底，紅十字總會未將所屬干細胞管理中心項目資金累計結轉和結餘25.32萬元納入2009年度部門決算和2010年部門預算，也未報經財政部門審核確認。2010年，干細胞管理中心使用上述資金用於原項目支出。
2.2010年12月，紅十字總會在「衛生救護師資培訓」項目結餘資金中列支30萬元，準備用於衛生救護培訓網絡管理系統培訓，但至2011年初，上述培訓尚未進行。
3.2010年，由於會計核算科目應用不當，紅十字總會將應用於「紅十字事業」的資金收支在往來款科目核算，其中年初結餘141.91萬元，當年收入30.93萬元，支出139.89萬元，年末結餘32.95萬元。且紅十字總會決算報表與實際賬簿資料不符，多計收入33.07萬元，少計支出75.89萬元，少計結餘32.95萬元。
4.2010年，所屬干細胞管理中心未經批准，在「中國造血干細胞捐獻者資料庫」項目中，列支了與該項目內容無關的抽檢費、紅十字總會新聞稿發佈服務費和會議費共計22.48萬元。 | 
