印控克什米爾地區的恐怖「潰瘍」遠未解決，也是誘發國內穆斯林激進化的重要原因。克什米爾問題牽涉印巴衝突、宗教衝突、分離主義與國際恐怖勢力等諸多矛盾，印控克什米爾地區歷來是印度暴力衝突最為頻繁、傷亡人數最多的地區。2010年6月以來，印控克什米爾地區爆發嚴重警民衝突，系近20年來最嚴重的社會騷亂。某種程度上看，由於印度政府繼續保持高壓統治態勢，民眾生活條件改善緩慢，印控克什米爾地區民眾對社會不公的反抗已經超過對分離主義的追求，成為催化社會騷亂和暴力衝突的最重要因素。
東北諸邦分離主義和左翼激進勢力的恐怖化，也成為困擾印度社會的頑疾。東北地區民族林立、經濟落後，與印度本土交通不便、文化各異，長期活躍著多股民族分離武裝，尤其以阿薩姆邦最為嚴重，而以印共為代表的左翼激進勢力，曾被辛格總理稱為「國內安全面臨的最大威脅」，擁有近2萬武裝。印度國內貧富兩極分化，使內部的貧富差距又與宗教、種族等因素交織糾纏在一起，並與更加複雜的國際因素相結合，從而為恐怖主義的產生、發展及暴力活動製造了適宜的溫床。 | 
