優化高鐵運行方案是本次運行圖調整的主要方面。即將開通運營的京滬高鐵運行圖已編製完成。該運行圖將安排開行時速300和250公里兩個速度等級的列車，實行兩種票價。初期每天開行動車組列車90對左右，包括京滬一站直達、省城之間直達和沿線車站交錯停車三種列車。在京滬高鐵通車運營後，既有的京滬線仍然保留136對普速客車，7月1日全國鐵路新的運行圖實施後再增加4對普速客車。同時，武廣高鐵、鄭西高鐵、滬寧高鐵也採取時速300和時速250公里兩種速度等級混跑模式，實行兩種票價。武廣、鄭西和滬寧城際高鐵日均分別安排動車組列車80對、22對和110對。在東南沿海鐵路，鐵路部門增開廈門-寧波東、福州-寧波東、廈門北-上海虹橋、廈門北-寧波東4對動車組列車。
京津城際鐵路和滬杭高鐵等高速鐵路將保持運營時速350公里。結合京滬高鐵跨線動車組開行方案，鐵路部門還將同步調整京津、膠濟、滬寧、滬杭等高鐵運行圖，並對昌九、合寧、合武動車組開行方案進行優化調整。
鐵道部相關人士表示，將京滬高鐵初期運營最高時速確定為300公里，並混合開行時速250公里動車組列車，以及武廣、鄭西、滬寧等長距離高速鐵路的運營由時速350公里單一模式調整為時速300和250公里兩種速度模式，主要目的是把廣大人民群眾滿意作為檢驗鐵路工作的根本標尺，更好地適應旅客多種乘車需求和經濟承受能力，讓廣大人民群眾乘車更加方便、快捷、舒適。此外，這種列車開行模式還有利於縮小列車運行速度差，提高線路通過能力，有利於提高長距離高鐵運營安全的可靠性，有利於降低能耗、減少噪音污染。 | 
